Сперва необходимо убедиться что у Вас есть более одного терминального доступа OpenSSH к серверу. Так как что в случае потери одного соединения, вы можете восстановить и получить доступ к серверу с помощью другого.
А теперь перейдем от отключению пользователя root. Открываем файл конфигурации OpenSSH сервера:
# nano /etc/ssh/sshd_config
Требуется раскомментировать (или добавить) строку:
PermitRootLogin no
Перезапускаем процесс OpenSSH любой из команд:
# /etc/init.d/sshd restart
# systemctl restart sshd
# service sshd restart
После чего авторизация по ssh пользователю root станет недоступна.
Кстати, если Вас интересуют абсолютно все настройки OpenSSH и их описание, то можно обратиться на данную страницу.